MeRIP-seqによる魚類の環境RNA(m6A)の温度応答解析
MeRIP-seqを用いて魚類のメチル化環境RNAにおける温度関連の変動を検出する
MeRIP-seq detects temperature related variation in methylated environmental...
MeRIP-seqを用いて魚類のメチル化環境RNAにおける温度関連の変動を検出する
MeRIP-seq detects temperature related variation in methylated environmental...
Collection of ITS2 region reference sequences for freshwater fish in the Japanese archipelago for environmental DNA...
MiFishプライマーを使った環境DNAメタバーコーディングでは、最終的に「どのサンプルで、どの魚種が、どの程度読まれたか」というテーブルが得られます。PMiFish のようなパイプラインを使えば、Raw FASTQから種同定までは比較的ス...
環境DNAで使用するデータベースを構築するスクリプトを作ってみたので解説します。分類群に依存せず魚類の他にも鳥類や両生類などにも対応しています。
ChatGPTやGeminiなどの対話型AIが普及しており、使わない日は無いかと思います。
これらのツールはWebブラウザ経由での利用が一般的ですが、一方、Local LLM(Large language model) と呼ばれる手元や社内...
μCeta: 非標的脊椎動物の増幅を最小限に抑えた環境DNAメタバーコーディングのためのクジラ目特異的プライマーセット μCeta: A Set of Cetacean-Specific Primers for Environmental DNA Metabarcoding With Minimal Amplification of Non-Target Vertebrates
水生昆虫における環境DNAメタバーコーディング: mtDNA 16S領域に基づくMtInsects-16SプライマーセットとmtDNA COI領域に基づく汎用マーカーの比較

Ficetolaが2008年に環境DNAでウシガエルを検出した事をきっかけに、環境DNAの検出技術は特定の種のみならず、複数種の同時検出が可能となりました。また、近年ではさらに生物の状態を反映するRNAの検出ができるようになってきています。

環境DNA技術を全体的に把握したい方向けに主要論文などの情報をまとめました。