Logo はじめての環境DNA
はじめての環境DNA

  • 便利情報
    • 環境DNAの主要な論文一覧、技術の全体像を把握したい方へ

    • メタバーコーディングプライマー

    • 環境DNA論文について

    • 遺伝子関連データベース・検索システム・リソース


/

  • Github X

  • 表示モード
  1. ホーム
  2. Blogs
論文解説 研究者・実務者向け 入門

環境DNAによる定量的な遺伝的多様性の評価

2020年6月8日2分間 ハプロタイプ 論文

大学時代に調査した内容が論文として公開されたため、宣伝も兼ねてまとめていきます。 これまでの系統地理研究や遺伝的多様性調査に役立ててもらえるよう、試行錯誤しながら取り組みました。

もっと読む
論文解説 研究者・実務者向け 入門

止水域での混ぜた場合と個別にサンプリングした場合の検出パターンの違い

2020年5月17日1分間 メタバーコーディング 論文

淡水魚類群集の環境DNAメタバーコーディングにおけるサンプルプーリングの有用性と限界

Usefulness and limitations of sample pooling for environmental DNA metabarcoding of freshwater fish communities

もっと読む
論文解説 研究者・実務者向け 入門

環境DNA論文 2020年4月

2020年5月16日2分間 論文

カマツカとヨシノボリを飼い始めました。

もっと読む
論文解説 研究者・実務者向け 入門

大型無脊椎動物全般の網羅的検出系開発(プレプリント)

2020年5月2日1分間 メタバーコーディング 論文

環境DNA(eDNA)を用いた水生無脊椎動物の検出精度向上:非標的増幅の最小化によるアプローチ Improved freshwater macroinvertebrate detection from eDNA through minimized non-target amplification

もっと読む
記事 初学者から実務者まで 入門

ヤマトサンショウウオを環境DNAで検出してみた

2020年3月24日1分間 検討

カエルの卵が観察できる小規模の湿地帯でサンショウウオの卵塊もあるとの情報を聞いて、情報元である会社の人に水をすくってきてもらいました。

もっと読む
論文解説 研究者・実務者向け 入門

環境DNA論文 2020年3月

2020年3月23日2分間 論文

先月は人生で初めて野外でサンショウウオを発見することができました。

もっと読む
論文解説 研究者・実務者向け 入門

魚類の網羅的検出系:MiFishプライマーの開発

2020年3月9日1分間 MiFish 論文

MiFish: 魚類の環境DNAをメタバーコーディングするためのユニバーサルPCRプライマーセット:230を超える亜熱帯性海洋種の検出 MiFish, a set of universal PCR primers for metabarcoding environmental DNA from fishes: detection of more than 230 subtropical marine species

もっと読む
記事 初学者から実務者まで 入門

MiFishパイプラインの開発

2020年3月9日1分間 メタバーコーディング 解析

MitoFish と MiFish パイプライン:環境DNAメタバーコーディングのための分析パイプラインを備えた魚類のミトコンドリアゲノムデータベース

MitoFish and MiFish pipeline: a mitochondrial genome database of fish with an analysis pipeline for environmental DNA metabarcoding

もっと読む
論文解説 研究者・実務者向け 入門

環境DNA論文 2020年2月

2020年3月9日3分間 論文

最近日も伸びて暖かい日が多くなり、水をすくうのが楽しみな季節が近づいてきました。

もっと読む
論文解説 研究者・実務者向け 入門

哺乳類の網羅的検出系:MiMammalの開発

2020年3月9日1分間 メタバーコーディング 論文

環境DNAは森林の池の水から陸生哺乳類の検出を可能にする

Environmental DNA enables detection of terrestrial mammals from forest pond water

もっと読む
  • ««
  • «
  • 1
  • 2
  • 3
  • 4
  • 5
  • »
  • »»
プロフィール
Naoki Shibata
Naoki Shibata
駆け出しバイオインフォマティシャン
Japan
AboutContact
分類
論文 30 メタバーコーディング 22 解析 7 検討 2 Bioinfomatics 1 全部 12
Database 2 メタバーコーディング 2 MiFish 1 MtInsect 1 メチル化 1 全部 7
2026 9 2025 1 2023 1 2022 2 2021 4 2020 26
投稿
  • MeRIP-seqによる魚類の環境RNA(m6A)の温度応答解析
    2026年4月19日
  • 環境DNAメタバーコーディング応用のための日本列島淡水魚のITS2領域参照配列の収集
    2026年4月5日
  • PMiFishとTaxonDBBuilderを使ってMiFish環境DNAデータをMaAsLin3で解析
    2026年3月28日
  • 自分の環境DNAリファレンスデータベースを作成する
    2026年2月8日
  • Local LLMで環境DNA論文の選別
    2026年1月21日

最近の投稿

最近の投稿
  • MeRIP-seqによる魚類の環境RNA(m6A)の温度応答解析
  • 環境DNAメタバーコーディング応用のための日本列島淡水魚のITS2領域参照配列の収集
  • PMiFishとTaxonDBBuilderを使ってMiFish環境DNAデータをMaAsLin3で解析
  • 自分の環境DNAリファレンスデータベースを作成する
  • Local LLMで環境DNA論文の選別

タグ

タグ
Database 2 メタバーコーディング 2 MiFish 1 MtInsect 1 メチル化 1 全部 7

はじめての環境DNA

研究室から現場まで、実践で使える知識を!

    • support
    • Contact