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  3. メタバーコーディング

MiFishプライマーに関するレビュー論文 Part1

2020年10月14日2分間 メタバーコーディング 論文

魚類の環境DNAをメタバーコーディングするためのユニバーサルプライマー (MiFish:マイフィッシュ) の開発者本人によるレビュー論文です。長いので数パートに分けて訳します。仕事や研究の手助けになれば嬉しいです。

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カリフォルニア海域用 MiFishデータベースの構築

2020年6月18日1分間 メタバーコーディング 論文

FishCARD: 効果的なメタバーコーディングのためのカリフォルニア海流域に特異的な魚類の12sのデータベース

FishCARD: Fish 12S California Current Specific Reference Database for Enhanced Metabarcoding Efforts

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止水域での混ぜた場合と個別にサンプリングした場合の検出パターンの違い

2020年5月17日1分間 メタバーコーディング 論文

淡水魚類群集の環境DNAメタバーコーディングにおけるサンプルプーリングの有用性と限界

Usefulness and limitations of sample pooling for environmental DNA metabarcoding of freshwater fish communities

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大型無脊椎動物全般の網羅的検出系開発(プレプリント)

2020年5月2日1分間 メタバーコーディング 論文

環境DNA(eDNA)を用いた水生無脊椎動物の検出精度向上:非標的増幅の最小化によるアプローチ Improved freshwater macroinvertebrate detection from eDNA through minimized non-target amplification

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MiFishパイプラインの開発

2020年3月9日1分間 メタバーコーディング 解析

MitoFish と MiFish パイプライン:環境DNAメタバーコーディングのための分析パイプラインを備えた魚類のミトコンドリアゲノムデータベース

MitoFish and MiFish pipeline: a mitochondrial genome database of fish with an analysis pipeline for environmental DNA metabarcoding

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哺乳類の網羅的検出系:MiMammalの開発

2020年3月9日1分間 メタバーコーディング 論文

環境DNAは森林の池の水から陸生哺乳類の検出を可能にする

Environmental DNA enables detection of terrestrial mammals from forest pond water

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甲殻類の網羅的検出系:MiDecaの開発

2020年3月9日1分間 メタバーコーディング 論文

十脚甲殻類の環境DNAメタバーコーディングのための新たなPCRプライマーセットの開発

Development of a new set of PCR primers for eDNA metabarcoding decapod crustaceans

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Naoki Shibata
Naoki Shibata
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Japan
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    2023年3月26日
  • Aria2とpigzでNCBI NtのBlastDBを作成する
    2022年3月26日
  • 水棲昆虫のDNAメタバーコーディング用プライマーセットの開発
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  • Sterivexを使用した環境DNAの抽出・精製の改良プロトコルについて Part1
    2021年7月10日
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