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記事 初学者から実務者まで 入門

環境DNAの技術を使って特定種の同定にチャレンジ その1?

2020年7月21日1分間 検討

ちょうど面白い検討も兼ねて、Miseqをランする機会でもあったので、お題の通り環境DNAの技術を流用して種の同定にチャレンジしました。

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記事 初学者から実務者まで 入門

ヤマトサンショウウオを環境DNAで検出してみた

2020年3月24日1分間 検討

カエルの卵が観察できる小規模の湿地帯でサンショウウオの卵塊もあるとの情報を聞いて、情報元である会社の人に水をすくってきてもらいました。

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プロフィール
Naoki Shibata
Naoki Shibata
駆け出しバイオインフォマティシャン
Japan
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分類
論文 30 メタバーコーディング 22 解析 7 検討 2 Bioinfomatics 1 全部 12
Database 2 メタバーコーディング 2 MiFish 1 MtInsect 1 メチル化 1 全部 7
2026 9 2025 1 2023 1 2022 2 2021 4 2020 26
投稿
  • MeRIP-seqによる魚類の環境RNA(m6A)の温度応答解析
    2026年4月19日
  • 環境DNAメタバーコーディング応用のための日本列島淡水魚のITS2領域参照配列の収集
    2026年4月5日
  • PMiFishとTaxonDBBuilderを使ってMiFish環境DNAデータをMaAsLin3で解析
    2026年3月28日
  • 自分の環境DNAリファレンスデータベースを作成する
    2026年2月8日
  • Local LLMで環境DNA論文の選別
    2026年1月21日

最近の投稿

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  • 環境DNAメタバーコーディング応用のための日本列島淡水魚のITS2領域参照配列の収集
  • PMiFishとTaxonDBBuilderを使ってMiFish環境DNAデータをMaAsLin3で解析
  • 自分の環境DNAリファレンスデータベースを作成する
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