MeRIP-seqを用いて魚類のメチル化環境RNAにおける温度関連の変動を検出する

Collection of ITS2 region reference sequences for freshwater fish in the Japanese archipelago for environmental DNA...

ChatGPTやGeminiなどの対話型AIが普及しており、使わない日は無いかと思います。

これらのツールはWebブラウザ経由での利用が一般的ですが、一方、Local LLM(Large language model) と呼ばれる手元や社内...

鳥類の検出ツールとしての環境DNAの可能性を実証

Demonstration of the potential of environmental DNA as a tool for the detection of avian species

μCeta: 非標的脊椎動物の増幅を最小限に抑えた環境DNAメタバーコーディングのためのクジラ目特異的プライマーセット μCeta: A Set of Cetacean-Specific Primers for Environmental DNA Metabarcoding With Minimal Amplification of Non-Target Vertebrates

水生昆虫における環境DNAメタバーコーディング: mtDNA 16S領域に基づくMtInsects-16SプライマーセットとmtDNA COI領域に基づく汎用マーカーの比較

Environmental DNA metabarcoding on aquatic insects: Comparing the primer sets of MtInsects‐16S based on the mtDNA 16S and general marker based on the mtDNA COI region

Ficetolaが2008年に環境DNAでウシガエルを検出した事をきっかけに、環境DNAの検出技術は特定の種のみならず、複数種の同時検出が可能となりました。また、近年ではさらに生物の状態を反映するRNAの検出ができるようになってきています。

環境DNA技術を全体的に把握したい方向けに主要論文などの情報をまとめました。

水生昆虫のDNAメタバーコーディングのための新規PCRプライマーセットの開発といくつかの隠蔽種の発見 Development of novel PCR primer sets for DNA metabarcoding of aquatic insects, and the discovery of some cryptic species

• 掲載誌: Limnology (Springer) / オンライン公開：2023-01-03(ページ：121–136)
• DOI: 10.1007/s10201-022-00710-5
• 日本の研究.com プレスリリース: https://research-er.jp/articles/view/118359
• プレプリント: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2021.11.05.467390v1.full
• レビュー論文: https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/ens.12616 🎉

Sterivexフィルターを使用した環境DNAの抽出・精製・測定のための改良されたプロトコルの野外適用 Field application of an improved protocol for environmental DNA extraction, purification, and measurement using Sterivex filter