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環境DNA論文 2020年5月

2020年6月10日2分間 論文

本格的に暑くなってきました。そしてすぐに梅雨入りしそうな予報です。

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環境DNAによる定量的な遺伝的多様性の評価

2020年6月8日2分間 ハプロタイプ 論文

大学時代に調査した内容が論文として公開されたため、宣伝も兼ねてまとめていきます。 これまでの系統地理研究や遺伝的多様性調査に役立ててもらえるよう、試行錯誤しながら取り組みました。

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止水域での混ぜた場合と個別にサンプリングした場合の検出パターンの違い

2020年5月17日1分間 メタバーコーディング 論文

淡水魚類群集の環境DNAメタバーコーディングにおけるサンプルプーリングの有用性と限界

Usefulness and limitations of sample pooling for environmental DNA metabarcoding of freshwater fish communities

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環境DNA論文 2020年4月

2020年5月16日2分間 論文

カマツカとヨシノボリを飼い始めました。

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大型無脊椎動物全般の網羅的検出系開発(プレプリント)

2020年5月2日1分間 メタバーコーディング 論文

環境DNA(eDNA)を用いた水生無脊椎動物の検出精度向上:非標的増幅の最小化によるアプローチ Improved freshwater macroinvertebrate detection from eDNA through minimized non-target amplification

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ヤマトサンショウウオを環境DNAで検出してみた

2020年3月24日1分間 検討

カエルの卵が観察できる小規模の湿地帯でサンショウウオの卵塊もあるとの情報を聞いて、情報元である会社の人に水をすくってきてもらいました。

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環境DNA論文 2020年3月

2020年3月23日2分間 論文

先月は人生で初めて野外でサンショウウオを発見することができました。

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魚類の網羅的検出系:MiFishプライマーの開発

2020年3月9日1分間 MiFish 論文

MiFish: 魚類の環境DNAをメタバーコーディングするためのユニバーサルPCRプライマーセット:230を超える亜熱帯性海洋種の検出 MiFish, a set of universal PCR primers for metabarcoding environmental DNA from fishes: detection of more than 230 subtropical marine species

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MiFishパイプラインの開発

2020年3月9日1分間 メタバーコーディング 解析

MitoFish と MiFish パイプライン:環境DNAメタバーコーディングのための分析パイプラインを備えた魚類のミトコンドリアゲノムデータベース

MitoFish and MiFish pipeline: a mitochondrial genome database of fish with an analysis pipeline for environmental DNA metabarcoding

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環境DNA論文 2020年2月

2020年3月9日3分間 論文

最近日も伸びて暖かい日が多くなり、水をすくうのが楽しみな季節が近づいてきました。

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Naoki Shibata
Naoki Shibata
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Japan
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  • 環境DNAの主要な論文一覧、技術の全体像を把握したい方へ
    2025年12月28日
  • 遺伝子関連データベース・検索システム・リソース
    2023年3月26日
  • Aria2とpigzでNCBI NtのBlastDBを作成する
    2022年3月26日
  • 水棲昆虫のDNAメタバーコーディング用プライマーセットの開発
    2022年1月22日
  • Sterivexを使用した環境DNAの抽出・精製の改良プロトコルについて Part1
    2021年7月10日
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