環境DNA(eDNA)を用いた水生無脊椎動物の検出精度向上：非標的増幅の最小化によるアプローチ Improved freshwater macroinvertebrate detection from eDNA through minimized non-target amplification
カエルの卵が観察できる小規模の湿地帯でサンショウウオの卵塊もあるとの情報を聞いて、情報元である会社の人に水をすくってきてもらいました。
先月は人生で初めて野外でサンショウウオを発見することができました。
MiFish: 魚類の環境DNAをメタバーコーディングするためのユニバーサルPCRプライマーセット：230を超える亜熱帯性海洋種の検出 MiFish, a set of universal PCR primers for metabarcoding environmental DNA from fishes: detection of more than 230 subtropical marine species
MitoFish と MiFish パイプライン：環境DNAメタバーコーディングのための分析パイプラインを備えた魚類のミトコンドリアゲノムデータベース
最近日も伸びて暖かい日が多くなり、水をすくうのが楽しみな季節が近づいてきました。
環境DNAは森林の池の水から陸生哺乳類の検出を可能にする
Environmental DNA enables detection of terrestrial mammals from forest pond water
十脚甲殻類の環境DNAメタバーコーディングのための新たなPCRプライマーセットの開発
Development of a new set of PCR primers for eDNA metabarcoding decapod crustaceans
大型脊椎動物を対象とした環境DNA分析が2008年に発表されてから執筆時点で12年が経ちました。環境DNAに関する論文は500本ほど発表されています。そんな数の論文を今から網羅するのはかなりしんどいです。
メタバーコーディングとは、DNA配列情報を用いてそのDNAがどの生物種に由来するのかを判別する手法です。