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論文解説 研究者・実務者向け 入門

環境DNAメタバーコーディング応用のための日本列島淡水魚のITS2領域参照配列の収集

2026年4月5日3分間 論文Databaseメタバーコーディング

Collection of ITS2 region reference sequences for freshwater fish in the Japanese archipelago for environmental DNA...

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データベース 実務者向け 中級

自分の環境DNAリファレンスデータベースを作成する

2026年2月8日9分間 解析DatabaseMiFishメタバーコーディング

環境DNAで使用するデータベースを構築するスクリプトを作ってみたので解説します。分類群に依存せず魚類の他にも鳥類や両生類などにも対応しています。

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プロフィール
Naoki Shibata
Naoki Shibata
駆け出しバイオインフォマティシャン
Japan
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分類
論文 30 メタバーコーディング 22 解析 7 検討 2 Bioinfomatics 1 全部 12
Database 2 メタバーコーディング 2 MiFish 1 MtInsect 1 メチル化 1 全部 7
2026 9 2025 1 2023 1 2022 2 2021 4 2020 26
投稿
  • MeRIP-seqによる魚類の環境RNA(m6A)の温度応答解析
    2026年4月19日
  • 環境DNAメタバーコーディング応用のための日本列島淡水魚のITS2領域参照配列の収集
    2026年4月5日
  • PMiFishとTaxonDBBuilderを使ってMiFish環境DNAデータをMaAsLin3で解析
    2026年3月28日
  • 自分の環境DNAリファレンスデータベースを作成する
    2026年2月8日
  • Local LLMで環境DNA論文の選別
    2026年1月21日

最近の投稿

最近の投稿
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  • 環境DNAメタバーコーディング応用のための日本列島淡水魚のITS2領域参照配列の収集
  • PMiFishとTaxonDBBuilderを使ってMiFish環境DNAデータをMaAsLin3で解析
  • 自分の環境DNAリファレンスデータベースを作成する
  • Local LLMで環境DNA論文の選別

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